在南太平洋海底的深处，新新人类协会的一座海底城坐落在一道海底山梁上，山梁其实是一个海底鼓起的斜坡，上面很平坦，在这个一千多米的深海海底，常年都是漆黑一片，水温常年保持在零摄氏度左右，偶尔有几条深海鳗鱼和鳐鱼从山梁上游过，由于见不到阳光，这里没有任何海下植物，甚至连浮游生物也没有，虽然环境冷酷，但是这里却有着很稳定的水体，风平浪静。
张克明教授此时正坐在这座水下组合式建筑自己的办公室里，刚刚结束的‘五人小组’会议给他的心头蒙上了一层阴影，严峻的形势让他最近作出的很多研究计划可能要重新修改。这座建筑的名字是张克明亲自给起的，因为喜欢古典小说《西游记》，他索性把这座深海建筑命名为水晶宫，经过了将近三十年的不断建设，水晶宫的规模已经很庞大。与佐藤宏介的海底龟城不同的是水晶宫采用了模块化的建造模式，外观形状像一个沉入海中的集装箱，只是体积要小一些，所有构成这个‘集装箱’的矩形小‘集装箱’舱室组合在一起，形成了一个非常稳定和坚固的整体，需要时可以分离，用自身的全电喷水动力系统自由行动，这和太空城的结构是相近似的，因为总设计师都是张克明，他喜欢模块化的组合设计，因为灵活和实用。
海下基地主要的运输和防御任务是由msi蜂鸟b-和蜂鸟a-20来担当，近百架蜂鸟a-20对于这个庞大的海底城日常使用是够了，但是如果发生意外，张克明很担心无法应对，唯一能够支援他的是童继武所负责的山中基地，蜂鸟a-20的数量多一些但也有限，费蒙的太空城距离太遥远，不用几天的时间是无法前来援助的。
由于感觉形势危急，张克明找来了一直负责海洋研究工作的龚庆国博士，想一起研究一下如何应对当前的局势。两个人年龄相当，脾气秉性也相似，只是龚庆国显得更加沉稳老成一些，张克明负责海底城的建设和管理，龚庆国则一直专心于各个研究组的研究项目和研究进度，两个人配合得很默契。在他们的管理下海底城现在已经实现了自给自足，从能源、材料和食物都是取之于海，并能生产出剩余的反物质燃料电池、新型复合材料、以及像msi蜂鸟a-20等机型的相关设备，提供给太空城。最近龚庆国博士的研究还发现，在他们所在位置的地壳下深处近千公里的位置，可能存在着大量的水，整个水体可能比地面上所有形态的水加起来还要多，他们准备进行采样分析，研究地壳深处的水体对于人类有无用处。
龚庆国多少也听张克明时常说一些现在的局势问题，但是没想到‘五人小组’最新的判断是与黑鹰社的战争一触即发，而且经过了近三十年的偃旗息鼓，黑鹰社的实力已经非同一般，平常只关心科学研究的龚庆国这时也担心了起来，向张克明建议说：“是不是把水晶宫分散到几处咱们的备选海域去比较好，现在咱们除了在北冰洋水下有一个小型海底研究室，都集中在了这里，是不是太危险了。”
听了龚庆国的建议，张克明点了点头说：“我也正在考虑这个问题，原来我们设置了一些水下电子信标作为警戒和迷惑敌人，但是从现在的情况来，这些信标都被不明人造物体接近过，但得到的信息却很少，无法分析具体情况，我现在觉得有可能是佐藤和李康他们派出的侦查小组，他们的黑鹰也能视觉隐身，而且他们在水下会使用蓝绿激光通信系统，咱们的电子信标视觉上无法发现，也不能拦截到激光通信，所以我判断形势不太妙，但过度分散也有被各个击破的危险……”
他们正在讨论对策的时候，安全组的负责人通过‘超弦’请求通话，他在屏幕上有些惊慌地说：“咱们设在不同水域和深度的电子信标显示，一支庞大的a国航母战斗群停留在了我们的正上方，一艘核潜艇刚刚快速下降到了咱们附近的海床上，距离约八海里，被动声纳系统同时发现两艘原本正常通过的核潜艇已经调转了方向，正从不同方向我们的海底城附近驶来，距离已经不到五十海里了。”
张克明也有些吃惊，这是很不寻常的事，这片海域虽然有军舰经常经过，但很少有舰队停留过，而且核潜艇从不同方向过来，明显目标就是海底城水晶宫。他略加思索后下令道：“你派出三个小队十二架蜂鸟a-20到附近去观察情况，不到万不得已不准使用武力，同时让三个中队的a-20做好战斗准备，全部挂载质子鱼雷和导弹，以防发生不测；另外，不要开启主动声纳等设备，用被动设备探测情况，注意不要使用海下聚光灯，从现在起全城临海的所有舷窗和外部照明设备施行灯火管制。中微子通讯系统是安全的，可以正常使用；隐身设备全部启动。”接连发布了几个指令之后，张克明决定立刻和费蒙取得联系，汇报这个意外的情况，并商量对策。
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一千多米的海底，对于伊利诺斯级攻击型核潜艇来说已经是下潜极限了，在深海海水巨大的压强下，艇体偶尔发出的吱嘎声让几艘前来救援的潜艇上的水兵不寒而栗，但这个时候时间就是生命，已经没有时间让他们虔诚地祈祷了。对于高层来讲，潜艇上的设备、武器等秘密才是最重要的，因此最先前来营救的两艘到达沉船海域的核潜艇，先是建立了海底警戒线，并放出了三艘微型无人潜艇在附近警戒和搜寻‘失事’的核潜艇的准确位置。